Ondanks de vele voordelen van de AirPods 3 zijn er ook enkele nadelen waar potentiële kopers rekening mee moeten houden. Ten eerste missen deze oordopjes actieve ruisonderdrukking, iets wat wel standaard is bij de duurdere AirPods Pro. Dit kan voor gebruikers die vaak in lawaaierige omgevingen zitten een gemis zijn, zeker omdat passieve isolatie beperkt is door het open ontwerp.
Daarnaast zijn de AirPods 3 relatief prijzig, vooral in vergelijking met concurrenten die vergelijkbare geluidskwaliteit en functies bieden. Het ontbreken van meegeleverde draadloze oplader betekent ook dat de MagSafe-functie alleen volledig tot zijn recht komt als je al een MagSafe- of Qi-oplader bezit of er een losse bij koopt, wat extra kosten met zich meebrengt.
Ook de pasvorm, hoewel verbeterd, is niet universeel ideaal. Sommige gebruikers ervaren dat de AirPods 3 minder stabiel blijven zitten tijdens intensieve sporten in vergelijking met in-ear modellen met siliconen tips. Dit kan voor sporters die veel bewegen een nadeel zijn.
Tot slot is de geluidskwaliteit wel uitstekend, maar iets minder gedetailleerd dan bij de Pro-versie met ANC en een strakkere basrespons. Voor audiofielen of gebruikers die maximale geluidsbeleving zoeken, is het daarom aan te raden om ook andere modellen te overwegen.